Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2C0

Cfap46, Cilia and flagella-associated protein 46, mousemouse

Predictions only

Length 2,641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap46E9Q2C0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cfap46E9Q2C0 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cfap46E9Q2C0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cfap46E9Q2C0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cfap46E9Q2C0 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cfap46E9Q2C0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cfap46E9Q2C0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms