Protein–RNA interactions for Protein: E9Q257

Gm8237, Predicted gene 8237, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8237E9Q257 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8237E9Q257 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8237E9Q257 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8237E9Q257 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8237E9Q257 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8237E9Q257 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8237E9Q257 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8237E9Q257 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8237E9Q257 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8237E9Q257 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8237E9Q257 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8237E9Q257 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8237E9Q257 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8237E9Q257 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8237E9Q257 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8237E9Q257 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8237E9Q257 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8237E9Q257 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8237E9Q257 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8237E9Q257 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8237E9Q257 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8237E9Q257 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8237E9Q257 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8237E9Q257 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8237E9Q257 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8237E9Q257 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8237E9Q257 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8237E9Q257 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8237E9Q257 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8237E9Q257 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8237E9Q257 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8237E9Q257 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8237E9Q257 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8237E9Q257 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8237E9Q257 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8237E9Q257 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8237E9Q257 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8237E9Q257 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8237E9Q257 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8237E9Q257 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8237E9Q257 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm8237E9Q257 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm8237E9Q257 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm8237E9Q257 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm8237E9Q257 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm8237E9Q257 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm8237E9Q257 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm8237E9Q257 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm8237E9Q257 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm8237E9Q257 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8237E9Q257 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8237E9Q257 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8237E9Q257 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8237E9Q257 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8237E9Q257 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8237E9Q257 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8237E9Q257 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8237E9Q257 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8237E9Q257 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8237E9Q257 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8237E9Q257 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8237E9Q257 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8237E9Q257 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8237E9Q257 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8237E9Q257 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8237E9Q257 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8237E9Q257 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8237E9Q257 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8237E9Q257 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8237E9Q257 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8237E9Q257 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8237E9Q257 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8237E9Q257 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8237E9Q257 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8237E9Q257 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8237E9Q257 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8237E9Q257 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8237E9Q257 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8237E9Q257 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8237E9Q257 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8237E9Q257 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8237E9Q257 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8237E9Q257 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8237E9Q257 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8237E9Q257 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8237E9Q257 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8237E9Q257 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8237E9Q257 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8237E9Q257 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8237E9Q257 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8237E9Q257 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8237E9Q257 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8237E9Q257 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8237E9Q257 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8237E9Q257 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8237E9Q257 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8237E9Q257 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8237E9Q257 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8237E9Q257 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8237E9Q257 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms