Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC4.37□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC4.37□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC4.37□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
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NebE9Q1W3 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 AC165260.3-201ENSMUST00000225101 665 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
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