Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Lrp3E9Q1T6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Lrp3E9Q1T6 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Lrp3E9Q1T6 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Lrp3E9Q1T6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Lrp3E9Q1T6 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Lrp3E9Q1T6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Lrp3E9Q1T6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Lrp3E9Q1T6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrp3E9Q1T6 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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