Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

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Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Pdzd2E9Q1M1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Pdzd2E9Q1M1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Pdzd2E9Q1M1 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Pdzd2E9Q1M1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Pdzd2E9Q1M1 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Pdzd2E9Q1M1 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Pdzd2E9Q1M1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pdzd2E9Q1M1 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
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