Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt78E9Q0F0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt78E9Q0F0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms