Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Fndc1E9Q043 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fndc1E9Q043 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fndc1E9Q043 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fndc1E9Q043 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fndc1E9Q043 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fndc1E9Q043 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Fndc1E9Q043 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fndc1E9Q043 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fndc1E9Q043 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fndc1E9Q043 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fndc1E9Q043 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fndc1E9Q043 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fndc1E9Q043 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fndc1E9Q043 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fndc1E9Q043 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fndc1E9Q043 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fndc1E9Q043 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fndc1E9Q043 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fndc1E9Q043 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fndc1E9Q043 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fndc1E9Q043 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fndc1E9Q043 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fndc1E9Q043 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fndc1E9Q043 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fndc1E9Q043 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fndc1E9Q043 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fndc1E9Q043 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fndc1E9Q043 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fndc1E9Q043 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fndc1E9Q043 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fndc1E9Q043 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fndc1E9Q043 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Fndc1E9Q043 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fndc1E9Q043 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fndc1E9Q043 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fndc1E9Q043 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Fndc1E9Q043 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fndc1E9Q043 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Fndc1E9Q043 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fndc1E9Q043 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fndc1E9Q043 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Fndc1E9Q043 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fndc1E9Q043 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fndc1E9Q043 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fndc1E9Q043 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fndc1E9Q043 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fndc1E9Q043 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fndc1E9Q043 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fndc1E9Q043 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms