Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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Ddx60E9PZQ1 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
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Ddx60E9PZQ1 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Ddx60E9PZQ1 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
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Ddx60E9PZQ1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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Ddx60E9PZQ1 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Ddx60E9PZQ1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms