Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM4

Chd2, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd2E9PZM4 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Chd2E9PZM4 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chd2E9PZM4 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chd2E9PZM4 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chd2E9PZM4 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Chd2E9PZM4 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chd2E9PZM4 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Chd2E9PZM4 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chd2E9PZM4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chd2E9PZM4 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chd2E9PZM4 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chd2E9PZM4 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chd2E9PZM4 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chd2E9PZM4 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chd2E9PZM4 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chd2E9PZM4 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Chd2E9PZM4 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chd2E9PZM4 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chd2E9PZM4 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chd2E9PZM4 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chd2E9PZM4 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chd2E9PZM4 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chd2E9PZM4 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Chd2E9PZM4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chd2E9PZM4 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chd2E9PZM4 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Chd2E9PZM4 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chd2E9PZM4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chd2E9PZM4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chd2E9PZM4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chd2E9PZM4 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chd2E9PZM4 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chd2E9PZM4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chd2E9PZM4 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chd2E9PZM4 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chd2E9PZM4 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chd2E9PZM4 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Chd2E9PZM4 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Chd2E9PZM4 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chd2E9PZM4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chd2E9PZM4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chd2E9PZM4 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chd2E9PZM4 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chd2E9PZM4 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chd2E9PZM4 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chd2E9PZM4 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chd2E9PZM4 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Chd2E9PZM4 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chd2E9PZM4 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chd2E9PZM4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chd2E9PZM4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chd2E9PZM4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chd2E9PZM4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chd2E9PZM4 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chd2E9PZM4 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chd2E9PZM4 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chd2E9PZM4 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chd2E9PZM4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chd2E9PZM4 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chd2E9PZM4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chd2E9PZM4 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chd2E9PZM4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chd2E9PZM4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chd2E9PZM4 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chd2E9PZM4 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chd2E9PZM4 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chd2E9PZM4 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms