Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF3

Gm5415, Predicted gene 5415, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5415E9PXF3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm5415E9PXF3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5415E9PXF3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5415E9PXF3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5415E9PXF3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5415E9PXF3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5415E9PXF3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5415E9PXF3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5415E9PXF3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5415E9PXF3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5415E9PXF3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5415E9PXF3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5415E9PXF3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5415E9PXF3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5415E9PXF3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5415E9PXF3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5415E9PXF3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5415E9PXF3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5415E9PXF3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5415E9PXF3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5415E9PXF3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5415E9PXF3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5415E9PXF3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5415E9PXF3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5415E9PXF3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5415E9PXF3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5415E9PXF3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5415E9PXF3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5415E9PXF3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5415E9PXF3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5415E9PXF3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5415E9PXF3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5415E9PXF3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5415E9PXF3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5415E9PXF3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5415E9PXF3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5415E9PXF3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5415E9PXF3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5415E9PXF3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5415E9PXF3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5415E9PXF3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5415E9PXF3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5415E9PXF3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5415E9PXF3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5415E9PXF3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5415E9PXF3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5415E9PXF3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5415E9PXF3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5415E9PXF3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5415E9PXF3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5415E9PXF3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5415E9PXF3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5415E9PXF3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5415E9PXF3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5415E9PXF3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5415E9PXF3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5415E9PXF3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5415E9PXF3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5415E9PXF3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5415E9PXF3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5415E9PXF3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5415E9PXF3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5415E9PXF3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5415E9PXF3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms