Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3002E9PW72 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms