Protein–RNA interactions for Protein: E9PW10

Triml2, Tripartite motif family-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Triml2E9PW10 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Triml2E9PW10 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Triml2E9PW10 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Triml2E9PW10 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms