Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms