Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc175E9PVB3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms