Protein–RNA interactions for Protein: E9PV48

Ifit3b, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3B, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit3bE9PV48 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifit3bE9PV48 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms