Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clca3bE9PUL3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Clca3bE9PUL3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms