Protein–RNA interactions for Protein: D3Z741

4930444G20Rik, RIKEN cDNA 4930444G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930444G20RikD3Z741 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930444G20RikD3Z741 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms