Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms