Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4S3

Ptrhd1, Putative peptidyl-tRNA hydrolase PTRHD1, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptrhd1D3Z4S3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ptrhd1D3Z4S3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptrhd1D3Z4S3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptrhd1D3Z4S3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptrhd1D3Z4S3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptrhd1D3Z4S3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptrhd1D3Z4S3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptrhd1D3Z4S3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms