Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2W7

Cyp3a59, Cytochrome P450, family 3, subfamily a, polypeptide 59, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp3a59D3Z2W7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cyp3a59D3Z2W7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cyp3a59D3Z2W7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cyp3a59D3Z2W7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cyp3a59D3Z2W7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cyp3a59D3Z2W7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cyp3a59D3Z2W7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cyp3a59D3Z2W7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cyp3a59D3Z2W7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cyp3a59D3Z2W7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cyp3a59D3Z2W7 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cyp3a59D3Z2W7 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Cyp3a59D3Z2W7 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cyp3a59D3Z2W7 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms