Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3543D3Z235 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms