Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc8D3YZV8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms