Protein–RNA interactions for Protein: D3YXJ9

Cldn24, Claudin, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn24D3YXJ9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn24D3YXJ9 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn24D3YXJ9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn24D3YXJ9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn24D3YXJ9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn24D3YXJ9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn24D3YXJ9 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn24D3YXJ9 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn24D3YXJ9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn24D3YXJ9 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn24D3YXJ9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn24D3YXJ9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn24D3YXJ9 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn24D3YXJ9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn24D3YXJ9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn24D3YXJ9 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn24D3YXJ9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn24D3YXJ9 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn24D3YXJ9 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn24D3YXJ9 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn24D3YXJ9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn24D3YXJ9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn24D3YXJ9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn24D3YXJ9 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn24D3YXJ9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn24D3YXJ9 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn24D3YXJ9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn24D3YXJ9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn24D3YXJ9 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn24D3YXJ9 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn24D3YXJ9 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn24D3YXJ9 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn24D3YXJ9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn24D3YXJ9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn24D3YXJ9 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn24D3YXJ9 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn24D3YXJ9 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn24D3YXJ9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn24D3YXJ9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn24D3YXJ9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn24D3YXJ9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn24D3YXJ9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn24D3YXJ9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn24D3YXJ9 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn24D3YXJ9 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn24D3YXJ9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn24D3YXJ9 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn24D3YXJ9 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn24D3YXJ9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn24D3YXJ9 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn24D3YXJ9 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn24D3YXJ9 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn24D3YXJ9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn24D3YXJ9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn24D3YXJ9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn24D3YXJ9 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn24D3YXJ9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn24D3YXJ9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn24D3YXJ9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn24D3YXJ9 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn24D3YXJ9 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn24D3YXJ9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn24D3YXJ9 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn24D3YXJ9 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn24D3YXJ9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn24D3YXJ9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn24D3YXJ9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn24D3YXJ9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn24D3YXJ9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn24D3YXJ9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn24D3YXJ9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn24D3YXJ9 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn24D3YXJ9 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn24D3YXJ9 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn24D3YXJ9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn24D3YXJ9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn24D3YXJ9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn24D3YXJ9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn24D3YXJ9 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn24D3YXJ9 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn24D3YXJ9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn24D3YXJ9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldn24D3YXJ9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldn24D3YXJ9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldn24D3YXJ9 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldn24D3YXJ9 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn24D3YXJ9 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn24D3YXJ9 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn24D3YXJ9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn24D3YXJ9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn24D3YXJ9 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn24D3YXJ9 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn24D3YXJ9 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn24D3YXJ9 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn24D3YXJ9 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn24D3YXJ9 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn24D3YXJ9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn24D3YXJ9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn24D3YXJ9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn24D3YXJ9 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms