Protein–RNA interactions for Protein: D3YW29

Rexo5, RNA exonuclease 5, mousemouse

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo5D3YW29 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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Rexo5D3YW29 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
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Rexo5D3YW29 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
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Rexo5D3YW29 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
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Rexo5D3YW29 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Rexo5D3YW29 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms