Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK0

Gm3259, Predicted gene 3259, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3259D3YUK0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3259D3YUK0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3259D3YUK0 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms