Protein–RNA interactions for Protein: C0HKC9

Smok3b, Sperm motility kinase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smok3bC0HKC9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms