Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cttnbp2B9EJA2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cttnbp2B9EJA2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cttnbp2B9EJA2 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cttnbp2B9EJA2 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cttnbp2B9EJA2 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cttnbp2B9EJA2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cttnbp2B9EJA2 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cttnbp2B9EJA2 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cttnbp2B9EJA2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cttnbp2B9EJA2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cttnbp2B9EJA2 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cttnbp2B9EJA2 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cttnbp2B9EJA2 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cttnbp2B9EJA2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cttnbp2B9EJA2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms