Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clip3B9EHT4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms