Protein–RNA interactions for Protein: B2RY53

Gm6133, EG620155 protein, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6133B2RY53 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm6133B2RY53 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm6133B2RY53 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms