Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyp26c1B2RXA7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms