Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Cspp1B2RX88 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms