Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Siah3B2RWG3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms