Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apba1B2RUJ5 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apba1B2RUJ5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms