Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Zscan5bB2RTN3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zscan5bB2RTN3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms