Protein–RNA interactions for Protein: B2RS76

Cpb1, Carboxypeptidase B1 (Tissue), isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpb1B2RS76 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cpb1B2RS76 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpb1B2RS76 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms