Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Brpf1B2RRD7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brpf1B2RRD7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms