Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brpf3B2KF05 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.2 ms