Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H60cB1B213 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H60cB1B213 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H60cB1B213 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H60cB1B213 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H60cB1B213 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H60cB1B213 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H60cB1B213 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H60cB1B213 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H60cB1B213 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H60cB1B213 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H60cB1B213 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.07■□□□□ 0
H60cB1B213 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H60cB1B213 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H60cB1B213 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
H60cB1B213 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H60cB1B213 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
H60cB1B213 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H60cB1B213 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H60cB1B213 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H60cB1B213 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H60cB1B213 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H60cB1B213 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H60cB1B213 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H60cB1B213 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H60cB1B213 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
H60cB1B213 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H60cB1B213 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H60cB1B213 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H60cB1B213 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H60cB1B213 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H60cB1B213 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H60cB1B213 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H60cB1B213 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H60cB1B213 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H60cB1B213 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H60cB1B213 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.06■□□□□ 0
H60cB1B213 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.06■□□□□ 0
H60cB1B213 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H60cB1B213 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
H60cB1B213 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
H60cB1B213 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.06■□□□□ 0
H60cB1B213 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.06■□□□□ 0
H60cB1B213 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.06■□□□□ 0
H60cB1B213 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H60cB1B213 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
H60cB1B213 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H60cB1B213 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H60cB1B213 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.06■□□□□ 0
H60cB1B213 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.06■□□□□ 0
H60cB1B213 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H60cB1B213 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H60cB1B213 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H60cB1B213 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H60cB1B213 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H60cB1B213 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H60cB1B213 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H60cB1B213 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H60cB1B213 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H60cB1B213 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H60cB1B213 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H60cB1B213 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H60cB1B213 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H60cB1B213 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H60cB1B213 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H60cB1B213 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H60cB1B213 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H60cB1B213 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H60cB1B213 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
H60cB1B213 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H60cB1B213 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H60cB1B213 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
H60cB1B213 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H60cB1B213 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H60cB1B213 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
H60cB1B213 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H60cB1B213 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H60cB1B213 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H60cB1B213 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
H60cB1B213 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
H60cB1B213 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.05■□□□□ -0
H60cB1B213 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.05■□□□□ -0
H60cB1B213 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.05■□□□□ -0
H60cB1B213 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
H60cB1B213 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
H60cB1B213 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H60cB1B213 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
H60cB1B213 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H60cB1B213 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H60cB1B213 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H60cB1B213 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H60cB1B213 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H60cB1B213 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
H60cB1B213 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H60cB1B213 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H60cB1B213 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H60cB1B213 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H60cB1B213 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H60cB1B213 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H60cB1B213 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms