Protein–RNA interactions for Protein: B1B1D3

Zfp40, Zinc finger protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp40B1B1D3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp40B1B1D3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms