Protein–RNA interactions for Protein: B1B0R1

Gm2012, Predicted gene 2012, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2012B1B0R1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm2012B1B0R1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm2012B1B0R1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm2012B1B0R1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm2012B1B0R1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm2012B1B0R1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm2012B1B0R1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm2012B1B0R1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm2012B1B0R1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm2012B1B0R1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm2012B1B0R1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm2012B1B0R1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm2012B1B0R1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm2012B1B0R1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm2012B1B0R1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm2012B1B0R1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm2012B1B0R1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm2012B1B0R1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm2012B1B0R1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm2012B1B0R1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm2012B1B0R1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm2012B1B0R1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm2012B1B0R1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm2012B1B0R1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm2012B1B0R1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm2012B1B0R1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm2012B1B0R1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm2012B1B0R1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm2012B1B0R1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm2012B1B0R1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm2012B1B0R1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm2012B1B0R1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm2012B1B0R1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm2012B1B0R1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm2012B1B0R1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm2012B1B0R1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm2012B1B0R1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm2012B1B0R1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm2012B1B0R1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm2012B1B0R1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm2012B1B0R1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm2012B1B0R1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm2012B1B0R1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm2012B1B0R1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm2012B1B0R1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm2012B1B0R1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm2012B1B0R1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm2012B1B0R1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm2012B1B0R1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm2012B1B0R1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm2012B1B0R1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm2012B1B0R1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm2012B1B0R1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm2012B1B0R1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm2012B1B0R1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm2012B1B0R1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm2012B1B0R1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm2012B1B0R1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm2012B1B0R1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm2012B1B0R1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm2012B1B0R1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm2012B1B0R1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm2012B1B0R1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm2012B1B0R1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm2012B1B0R1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm2012B1B0R1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm2012B1B0R1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm2012B1B0R1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm2012B1B0R1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm2012B1B0R1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm2012B1B0R1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm2012B1B0R1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm2012B1B0R1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm2012B1B0R1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm2012B1B0R1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm2012B1B0R1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm2012B1B0R1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm2012B1B0R1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm2012B1B0R1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm2012B1B0R1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm2012B1B0R1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm2012B1B0R1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm2012B1B0R1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm2012B1B0R1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm2012B1B0R1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm2012B1B0R1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm2012B1B0R1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm2012B1B0R1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm2012B1B0R1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm2012B1B0R1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm2012B1B0R1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm2012B1B0R1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm2012B1B0R1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm2012B1B0R1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm2012B1B0R1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm2012B1B0R1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm2012B1B0R1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm2012B1B0R1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm2012B1B0R1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm2012B1B0R1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms