Protein–RNA interactions for Protein: B1AZ99

Otud3, OTU domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud3B1AZ99 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otud3B1AZ99 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.3 ms