Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms