Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Gm6880A3KG45 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Gm6880A3KG45 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
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Gm6880A3KG45 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Gm6880A3KG45 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Gm6880A3KG45 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm6880A3KG45 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm6880A3KG45 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm6880A3KG45 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm6880A3KG45 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm6880A3KG45 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm6880A3KG45 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Gm6880A3KG45 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm6880A3KG45 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm6880A3KG45 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6880A3KG45 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6880A3KG45 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Gm6880A3KG45 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Gm6880A3KG45 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm6880A3KG45 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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