Protein–RNA interactions for Protein: A2RTF1

Catsperb, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatsperbA2RTF1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CatsperbA2RTF1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CatsperbA2RTF1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CatsperbA2RTF1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CatsperbA2RTF1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CatsperbA2RTF1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CatsperbA2RTF1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CatsperbA2RTF1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CatsperbA2RTF1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CatsperbA2RTF1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CatsperbA2RTF1 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CatsperbA2RTF1 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CatsperbA2RTF1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CatsperbA2RTF1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CatsperbA2RTF1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CatsperbA2RTF1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CatsperbA2RTF1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CatsperbA2RTF1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CatsperbA2RTF1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CatsperbA2RTF1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CatsperbA2RTF1 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CatsperbA2RTF1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CatsperbA2RTF1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CatsperbA2RTF1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CatsperbA2RTF1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CatsperbA2RTF1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CatsperbA2RTF1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CatsperbA2RTF1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CatsperbA2RTF1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CatsperbA2RTF1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CatsperbA2RTF1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CatsperbA2RTF1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CatsperbA2RTF1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CatsperbA2RTF1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CatsperbA2RTF1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CatsperbA2RTF1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CatsperbA2RTF1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CatsperbA2RTF1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CatsperbA2RTF1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CatsperbA2RTF1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CatsperbA2RTF1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CatsperbA2RTF1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CatsperbA2RTF1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CatsperbA2RTF1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms