Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms