Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CtcflA2APF3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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