Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Syndig1A2ANU3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms