Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lcn6A2AJB9 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms