Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prdm12A2AJ77 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms