Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ambra1A2AH22 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ambra1A2AH22 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ambra1A2AH22 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ambra1A2AH22 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ambra1A2AH22 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ambra1A2AH22 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ambra1A2AH22 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ambra1A2AH22 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ambra1A2AH22 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ambra1A2AH22 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ambra1A2AH22 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ambra1A2AH22 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ambra1A2AH22 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ambra1A2AH22 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ambra1A2AH22 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ambra1A2AH22 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ambra1A2AH22 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ambra1A2AH22 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ambra1A2AH22 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ambra1A2AH22 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ambra1A2AH22 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ambra1A2AH22 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ambra1A2AH22 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ambra1A2AH22 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ambra1A2AH22 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ambra1A2AH22 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ambra1A2AH22 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ambra1A2AH22 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ambra1A2AH22 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ambra1A2AH22 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ambra1A2AH22 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ambra1A2AH22 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ambra1A2AH22 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ambra1A2AH22 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ambra1A2AH22 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ambra1A2AH22 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ambra1A2AH22 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ambra1A2AH22 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ambra1A2AH22 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ambra1A2AH22 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ambra1A2AH22 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ambra1A2AH22 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ambra1A2AH22 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ambra1A2AH22 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ambra1A2AH22 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ambra1A2AH22 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ambra1A2AH22 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ambra1A2AH22 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ambra1A2AH22 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ambra1A2AH22 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ambra1A2AH22 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ambra1A2AH22 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ambra1A2AH22 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ambra1A2AH22 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ambra1A2AH22 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ambra1A2AH22 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ambra1A2AH22 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ambra1A2AH22 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ambra1A2AH22 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ambra1A2AH22 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ambra1A2AH22 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ambra1A2AH22 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ambra1A2AH22 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ambra1A2AH22 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ambra1A2AH22 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ambra1A2AH22 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ambra1A2AH22 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ambra1A2AH22 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ambra1A2AH22 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ambra1A2AH22 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ambra1A2AH22 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ambra1A2AH22 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ambra1A2AH22 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ambra1A2AH22 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ambra1A2AH22 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ambra1A2AH22 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ambra1A2AH22 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ambra1A2AH22 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ambra1A2AH22 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ambra1A2AH22 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ambra1A2AH22 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ambra1A2AH22 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ambra1A2AH22 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ambra1A2AH22 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ambra1A2AH22 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ambra1A2AH22 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ambra1A2AH22 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ambra1A2AH22 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ambra1A2AH22 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ambra1A2AH22 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ambra1A2AH22 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ambra1A2AH22 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ambra1A2AH22 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ambra1A2AH22 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ambra1A2AH22 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ambra1A2AH22 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ambra1A2AH22 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ambra1A2AH22 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ambra1A2AH22 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms